MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus influenzae PittEE chromosome

Total Repeats: 38427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009566	GGC	2	6	32	37	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009566	GAA	3	9	53	61	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009566	ATG	2	6	111	116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009566	TGC	2	6	145	150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009566	GTT	2	6	191	196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009566	A	7	7	305	311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009566	TTTC	2	8	330	337	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009566	GAA	2	6	353	358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009566	GAA	2	6	376	381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009566	TGCAT	2	10	443	452	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_009566	TAT	2	6	457	462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009566	TGG	2	6	488	493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009566	CTTTC	2	10	513	522	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_009566	ATC	2	6	530	535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009566	TAG	2	6	603	608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009566	TAGT	2	8	702	709	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009566	TATT	2	8	750	757	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009566	TCT	2	6	779	784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009566	TTAGTG	2	12	914	925	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009566	GTA	2	6	1019	1024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009566	TA	3	6	1035	1040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009566	CAA	2	6	1128	1133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_009566	TAAAA	2	10	1158	1167	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009566	ATG	2	6	1183	1188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009566	CCA	2	6	1216	1221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_009566	TGG	2	6	1243	1248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009566	CAA	2	6	1278	1283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_009566	ATA	2	6	1329	1334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009566	AATC	2	8	1367	1374	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_009566	TTG	2	6	1379	1384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009566	ATT	4	12	1419	1430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009566	T	8	8	1429	1436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009566	AACC	9	36	1523	1558	50 %	0 %	0 %	50 %	148825134
34	NC_009566	AAC	2	6	1577	1582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148825134
35	NC_009566	TGT	2	6	1731	1736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148825134
36	NC_009566	GTG	2	6	1775	1780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148825134
37	NC_009566	TCT	2	6	1837	1842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148825134
38	NC_009566	AAT	2	6	1882	1887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825134
39	NC_009566	AAG	2	6	1919	1924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825134
40	NC_009566	TCAA	2	8	1948	1955	50 %	25 %	0 %	25 %	148825134
41	NC_009566	AGTGGT	2	12	1957	1968	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	148825134
42	NC_009566	AATC	2	8	2071	2078	50 %	25 %	0 %	25 %	148825134
43	NC_009566	ACA	2	6	2134	2139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148825134
44	NC_009566	AGA	2	6	2140	2145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825134
45	NC_009566	A	7	7	2203	2209	100 %	0 %	0 %	0 %	148825134
46	NC_009566	ATT	2	6	2250	2255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825134
47	NC_009566	ATC	2	6	2282	2287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148825134
48	NC_009566	GCA	2	6	2299	2304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148825134
49	NC_009566	A	6	6	2360	2365	100 %	0 %	0 %	0 %	148825134
50	NC_009566	TC	3	6	2450	2455	0 %	50 %	0 %	50 %	148825134
51	NC_009566	CAAAA	2	10	2492	2501	80 %	0 %	0 %	20 %	148825134
52	NC_009566	A	6	6	2498	2503	100 %	0 %	0 %	0 %	148825134
53	NC_009566	A	6	6	2639	2644	100 %	0 %	0 %	0 %	148825134
54	NC_009566	A	6	6	2660	2665	100 %	0 %	0 %	0 %	148825134
55	NC_009566	AG	3	6	2729	2734	50 %	0 %	50 %	0 %	148825134
56	NC_009566	AAG	2	6	2837	2842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825134
57	NC_009566	A	8	8	2852	2859	100 %	0 %	0 %	0 %	148825134
58	NC_009566	AAAT	2	8	2861	2868	75 %	25 %	0 %	0 %	148825134
59	NC_009566	AGGATA	2	12	2891	2902	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148825134
60	NC_009566	ATA	3	9	2900	2908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825134
61	NC_009566	CTT	2	6	2942	2947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148825134
62	NC_009566	ATA	2	6	3077	3082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825134
63	NC_009566	ATG	2	6	3116	3121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825134
64	NC_009566	TGG	2	6	3136	3141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148825134
65	NC_009566	AAAC	2	8	3164	3171	75 %	0 %	0 %	25 %	148825134
66	NC_009566	CA	3	6	3183	3188	50 %	0 %	0 %	50 %	148825134
67	NC_009566	CTTA	2	8	3260	3267	25 %	50 %	0 %	25 %	148825134
68	NC_009566	TGT	2	6	3312	3317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148825134
69	NC_009566	ATT	2	6	3326	3331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825134
70	NC_009566	ATTTG	2	10	3336	3345	20 %	60 %	20 %	0 %	148825134
71	NC_009566	TGA	2	6	3411	3416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825134
72	NC_009566	ATA	2	6	3455	3460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825134
73	NC_009566	ATG	2	6	3461	3466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825134
74	NC_009566	TTA	2	6	3470	3475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825134
75	NC_009566	AAACA	2	10	3511	3520	80 %	0 %	0 %	20 %	148825134
76	NC_009566	A	6	6	3520	3525	100 %	0 %	0 %	0 %	148825134
77	NC_009566	TTC	2	6	3575	3580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148825134
78	NC_009566	TACAT	2	10	3720	3729	40 %	40 %	0 %	20 %	148825134
79	NC_009566	ATG	2	6	3731	3736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825134
80	NC_009566	TA	3	6	3797	3802	50 %	50 %	0 %	0 %	148825134
81	NC_009566	TTAG	2	8	3823	3830	25 %	50 %	25 %	0 %	148825134
82	NC_009566	GTA	2	6	3886	3891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825134
83	NC_009566	AATT	2	8	3903	3910	50 %	50 %	0 %	0 %	148825134
84	NC_009566	ATGG	2	8	3943	3950	25 %	25 %	50 %	0 %	148825134
85	NC_009566	AATG	2	8	4008	4015	50 %	25 %	25 %	0 %	148825134
86	NC_009566	ACC	2	6	4055	4060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148825134
87	NC_009566	ACC	2	6	4090	4095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148825134
88	NC_009566	AGA	2	6	4116	4121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825134
89	NC_009566	TA	3	6	4253	4258	50 %	50 %	0 %	0 %	148825134
90	NC_009566	AACA	2	8	4334	4341	75 %	0 %	0 %	25 %	148825134
91	NC_009566	TCAGT	2	10	4393	4402	20 %	40 %	20 %	20 %	148825134
92	NC_009566	TGT	2	6	4416	4421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009566	AAAAT	2	10	4423	4432	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009566	T	6	6	4491	4496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009566	TGTA	2	8	4527	4534	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009566	ATT	2	6	4622	4627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009566	CGA	2	6	4646	4651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_009566	C	7	7	4684	4690	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
99	NC_009566	AAT	2	6	4770	4775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009566	ATA	2	6	4832	4837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009566	AC	3	6	4929	4934	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_009566	GTA	2	6	4970	4975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009566	TGA	2	6	5019	5024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009566	A	6	6	5030	5035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009566	TCA	2	6	5083	5088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_009566	ATT	2	6	5108	5113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009566	GGC	2	6	5138	5143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_009566	TGTT	2	8	5156	5163	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009566	TGAT	2	8	5187	5194	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009566	TTGG	2	8	5232	5239	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009566	TAT	2	6	5269	5274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009566	TCC	2	6	5302	5307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_009566	TCA	2	6	5335	5340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_009566	GAA	2	6	5396	5401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009566	AAATG	2	10	5479	5488	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009566	TTA	2	6	5572	5577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009566	ATT	2	6	5601	5606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009566	ATT	2	6	5632	5637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009566	ATTT	2	8	5644	5651	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009566	A	6	6	5659	5664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009566	TAA	2	6	5699	5704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009566	ATTA	2	8	5772	5779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009566	TTAC	2	8	5851	5858	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_009566	TTC	2	6	5881	5886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_009566	TCA	2	6	5906	5911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_009566	TCA	2	6	5918	5923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_009566	CTG	3	9	5939	5947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_009566	TGC	3	9	5952	5960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_009566	CTG	2	6	6014	6019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_009566	ATG	2	6	6052	6057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009566	TTC	2	6	6066	6071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_009566	GTT	2	6	6169	6174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009566	AAC	2	6	6212	6217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_009566	AAAG	2	8	6245	6252	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009566	GTT	2	6	6263	6268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009566	TGG	2	6	6328	6333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009566	CAT	2	6	6336	6341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_009566	ACA	2	6	6343	6348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_009566	GAA	2	6	6452	6457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009566	TAT	2	6	6499	6504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009566	TGC	2	6	6556	6561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_009566	TTTC	2	8	6564	6571	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_009566	CAA	2	6	6606	6611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_009566	GCA	2	6	6653	6658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_009566	GCA	2	6	6731	6736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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148	NC_009566	TGT	2	6	6885	6890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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